Software con Verifactu para profesionales sanitarios: cómo cumplir sin complicaciones
- Iñigo Ardanza
- 13 min de lectura
Actualizado en junio de 2026
Resumen: Desde julio de 2027, todos los autónomos que usen software para facturar están obligados a cumplir con Verifactu. Si eres psicólogo, fisioterapeuta, médico o cualquier otro profesional sanitario autónomo, esto te afecta directamente. En esta guía explicamos qué significa en la práctica, qué debe tener el software que elijas y por qué un programa de gestión clínica con Verifactu integrado resuelve el cumplimiento sin añadir carga administrativa.
Qué es Verifactu y por qué afecta a los profesionales sanitarios autónomos
Verifactu es el sistema de facturación impulsado por la Agencia Tributaria (AEAT) para garantizar que las facturas emitidas con software no puedan modificarse ni eliminarse una vez registradas. Cualquier programa que uses para facturar debe cumplir sus requisitos técnicos: inalterabilidad, trazabilidad y, opcionalmente, envío automático de registros a Hacienda en tiempo real.
Para los profesionales sanitarios autónomos en España esto es relevante por una razón muy concreta: si emites facturas con un software —ya sea un programa de facturación genérico, un ERP o un software de gestión clínica—, ese software debe cumplir con Verifactu antes del 1 de julio de 2027 según el Real Decreto 1007/2023, con las modificaciones introducidas por el Real Decreto 254/2025 que amplió los plazos originales.
Una aclaración importante que genera mucha confusión: Verifactu y la factura electrónica B2B son dos normativas distintas. Verifactu afecta a cómo el software gestiona internamente las facturas. La factura electrónica B2B (Ley Crea y Crece) afecta al formato de intercambio entre empresas y tiene plazos diferentes. Puedes leer la diferencia en detalle en nuestra guía sobre Ley Antifraude y Verifactu para clínicas.
¿Están obligados los profesionales sanitarios a usar Verifactu?
Sí, con una condición: que uses software para facturar. Si emites tus facturas exclusivamente en papel o con plantillas de Word o Excel sin guardar registros digitales, quedas exento. Pero si usas cualquier programa informático para gestionar tu facturación —lo que incluye la mayoría de profesionales sanitarios hoy en día—, tu software debe ser compatible con Verifactu.
Las excepciones más relevantes para el sector sanitario son:
- Autónomos en País Vasco o Navarra: están sujetos a sus propios regímenes forales (TicketBAI), no a Verifactu.
- Autónomos en módulos que solo facturan a particulares y no usan software informático para ello.
- Profesionales acogidos al SII (Suministro Inmediato de Información): aplica principalmente a grandes empresas, no a autónomos individuales.
Para la mayoría de psicólogos, fisioterapeutas, logopedas, nutricionistas y médicos autónomos que usan software para gestionar su consulta, la obligación aplica sin excepciones.
Verifactu vs factura electrónica: la diferencia que debes entender
| Verifactu | Factura electrónica B2B | |
|---|---|---|
| Qué regula | Cómo el software gestiona los registros internamente: inalterabilidad y trazabilidad | El formato digital de intercambio de facturas entre empresas y autónomos |
| A quién afecta | Todo autónomo o empresa que use software para facturar en España | Solo en operaciones B2B (entre empresas y autónomos) |
| Plazo autónomos | 1 de julio de 2027 | 1 de octubre de 2028 (para la mayoría de autónomos) |
| Afecta a facturas a pacientes | Sí — todas las facturas deben cumplir el estándar técnico | No — solo aplica a facturas entre empresas, no a particulares |
| Qué debes hacer | Usar software certificado que garantice inalterabilidad y QR verificable | Emitir y recibir facturas en formato digital estandarizado (Facturae) |
| Envío a Hacienda | Opcional (modalidad Verifactu) o bajo demanda (modalidad NO Verifactu) | Requerido para facturas B2B una vez entre en vigor |
La confusión entre ambas normativas es frecuente. En términos prácticos:
Verifactu exige que tu software garantice que las facturas no se puedan borrar ni alterar, que cada factura tenga un código identificativo único y un QR verificable, y que el sistema mantenga un registro de auditoría. El envío a Hacienda en tiempo real es la modalidad optativa — lo que es obligatorio es que el software cumpla los requisitos técnicos.
Factura electrónica B2B exige que tus facturas a otras empresas o autónomos se emitan en formato digital estandarizado. Para profesionales sanitarios que facturan principalmente a pacientes particulares, esta segunda normativa tiene menos impacto inmediato.
Qué debe tener un software con Verifactu para profesionales sanitarios
Un software de facturación genérico puede cumplir con Verifactu técnicamente, pero un profesional sanitario necesita algo más. Estas son las características que debe combinar:
Software con Verifactu según tu especialidad sanitaria
Las obligaciones fiscales son las mismas para todos los profesionales sanitarios autónomos, pero las necesidades del software varían según la especialidad. Aquí un resumen por perfil:
| Especialidad | Particularidad fiscal | Necesita en el software |
|---|---|---|
| Psicólogos | Exención de IVA en servicios psicológicos | HCE con notas de sesión Bonos de sesiones Verifactu |
| Fisioterapeutas | Exención de IVA en fisioterapia y bonos de sesiones prepagados | Control de bonos Facturación a mutuas Verifactu |
| Logopedas | Exención de IVA en logopedia; pacientes menores frecuentes | Consentimientos para menores Verifactu |
| Nutricionistas | Tributación variable según tipo de servicio (sanitario o no) | Agenda integrada Facturación flexible Verifactu |
| Médicos | Exención de IVA en medicina; facturación a aseguradoras | HCE completa Facturación a seguros Verifactu |
| Dentistas | IVA en prótesis y estética; presupuestos por fases | Odontograma Presupuestos por fases Verifactu |
El coste real de no preparar tu software a tiempo
Las sanciones por usar un software que no cumpla con Verifactu pueden llegar a 50.000 euros por ejercicio fiscal según la normativa vigente. Pero más allá de la sanción económica, el problema práctico para un profesional sanitario es distinto: si tu software no está adaptado cuando llegue la fecha límite, tendrás que cambiar de herramienta bajo presión, con el riesgo de perder datos históricos y paralizar la operativa de tu consulta.
Prepararse con tiempo significa elegir ahora un software que ya tenga Verifactu integrado y que además cubra el resto de necesidades de tu consulta: agenda, historia clínica, LOPD y consentimientos. Así el cumplimiento fiscal no es una tarea separada, sino algo que ocurre automáticamente cada vez que emites una factura.
Preguntas frecuentes sobre software con Verifactu para sanitarios
¿Qué software cumple con Verifactu para autónomos sanitarios?
Para profesionales sanitarios lo más práctico es usar un software de gestión clínica con Verifactu integrado, como Docfav, en lugar de combinar un software clínico con un programa de facturación separado. De esta forma el cumplimiento fiscal y la gestión clínica ocurren en el mismo entorno, sin trasladar datos entre sistemas.
¿Cuándo es obligatorio Verifactu para autónomos?
Según el calendario establecido por el Real Decreto 1007/2023 y las modificaciones del Real Decreto 254/2025, Verifactu será obligatorio para autónomos a partir del 1 de julio de 2027. Para sociedades y personas jurídicas el plazo es el 1 de enero de 2027. Si usas software para facturar, debes asegurarte de que sea compatible antes de esa fecha.
¿Verifactu es opcional o es obligatorio?
El cumplimiento técnico del estándar Verifactu en el software es obligatorio para quienes usan programas informáticos para facturar. Lo que es opcional es la modalidad de envío automático a Hacienda en tiempo real: puedes elegir la modalidad Verifactu (envío automático) o la modalidad NO Verifactu (el software cumple los requisitos técnicos pero no envía automáticamente). En ambos casos, el software debe estar certificado.
¿Qué diferencia hay entre Verifactu y la factura electrónica?
Verifactu regula cómo el software gestiona los registros de facturación internamente: inalterabilidad, trazabilidad y opcionalmente envío a Hacienda en tiempo real. La factura electrónica B2B regula el formato de intercambio de facturas entre empresas. Son dos normativas distintas con plazos diferentes. La mayoría de profesionales sanitarios que facturan a pacientes particulares se ven más afectados por Verifactu que por la factura electrónica B2B.
¿Los profesionales sanitarios autónomos están obligados a usar Verifactu?
Sí, si usan software para facturar. La obligación aplica a todos los autónomos que utilizan programas informáticos para emitir sus facturas, independientemente del sector. Las excepciones son los autónomos que facturan exclusivamente en papel, los que operan en País Vasco o Navarra bajo TicketBAI, y los acogidos al SII.
¿Cuánto cuesta un software con Verifactu integrado para una consulta sanitaria?
El coste varía según la plataforma y el número de usuarios. Lo relevante para un profesional sanitario no es solo el precio del software, sino qué incluye: si cubre agenda, historia clínica, LOPD, consentimientos y Verifactu en un único plan, el coste por funcionalidad es significativamente inferior a combinar herramientas separadas. Puedes consultar los planes de Docfav directamente en la plataforma para ver los precios actuales.
