Facturación en fisioterapia: IVA, IRPF y Verifactu paso a paso
Última actualización: abril 2026. Este artículo tiene carácter informativo general. Para dudas específicas sobre tu situación fiscal, consulta con un asesor tributario.
Facturar correctamente en fisioterapia no es complicado, pero tiene suficientes particularidades fiscales como para que más de un profesional cometa errores sin saberlo: IVA mal aplicado, retención de IRPF que falta, o facturas que a partir de ahora deben cumplir con Verifactu.
Esta guía cubre todo lo que necesitas saber si eres fisioterapeuta autónomo o diriges una clínica de fisioterapia: qué tipo de factura emitir, cuándo aplica el IVA, cómo gestionar el IRPF y qué implica Verifactu para tu actividad.
¿Cómo debe facturar un fisioterapeuta?
Todo fisioterapeuta en ejercicio —ya sea autónomo o a través de una sociedad— está obligado a emitir factura por los servicios que presta. Esto aplica desde el primer paciente y desde el primer día de actividad, sin excepción.
Existen dos tipos de factura según el importe y el destinatario:
Factura completa
Incluye los datos completos del emisor (nombre, NIF, dirección) y del receptor (datos del paciente o de la entidad pagadora). Es obligatoria cuando el importe supera los 400 € o cuando el destinatario es una empresa o aseguradora que la necesita para su contabilidad.
Campos obligatorios en cualquier factura de fisioterapia:
- Número de factura (secuencial, sin saltos)
- Fecha de emisión
- Datos del emisor: nombre o razón social, NIF y dirección
- Datos del receptor (en factura completa)
- Descripción del servicio prestado
- Importe total
- Indicación de exención de IVA si aplica (con el artículo legal correspondiente)
Factura simplificada
Es el equivalente al ticket. Puede emitirse cuando el importe no supera los 400 € y el destinatario es un consumidor final (un paciente particular que no necesita la factura para deducirla). No requiere los datos del receptor.
¿La fisioterapia lleva IVA?
Esta es la pregunta que más confusión genera. La respuesta corta: depende del servicio.
Los servicios de fisioterapia con finalidad sanitaria —diagnóstico, prevención y tratamiento de enfermedades— están exentos de IVA según el artículo 20.Uno.3º de la Ley 37/1992 del IVA. En estos casos, la factura debe incluir la mención: «Exento de IVA — Art. 20.Uno.3º Ley 37/1992».
Sin embargo, no todos los servicios de un fisioterapeuta están exentos. Cuando la actividad no tiene finalidad terapéutica, se aplica el tipo general del 21 %.
| Tipo de servicio | Descripción | IVA aplicable |
|---|---|---|
|
Tratamiento terapéutico
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Sesiones de fisioterapia para el tratamiento de lesiones, dolor crónico, rehabilitación postoperatoria o cualquier patología con prescripción médica o finalidad sanitaria.
|
Exento |
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Diagnóstico y valoración
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Evaluación inicial del paciente, exploración funcional y elaboración del plan de tratamiento con finalidad clínica.
|
Exento |
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Prevención de lesiones
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Programas de ejercicio terapéutico o pautas preventivas con objetivo sanitario documentado.
|
Exento |
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Masaje de bienestar
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Masajes relajantes, estéticos o de bienestar sin finalidad terapéutica ni prescripción médica.
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21 % IVA |
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Clases de pilates / ejercicio
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Clases grupales o individuales de pilates, yoga terapéutico u otras actividades sin prescripción médica individual.
|
21 % IVA |
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Formación y cursos
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Cursos de formación para otros profesionales u organizaciones. No tienen finalidad asistencial directa.
|
21 % IVA |
El criterio clave es la finalidad del servicio, no el profesional que lo presta. Si un fisioterapeuta imparte un curso de pilates o realiza masajes de bienestar sin prescripción médica, esos servicios sí llevan IVA al 21 %.
Para no tener dudas en casos concretos, lo más recomendable es consultarlo con tu asesor fiscal, que conocerá la casuística específica de tu actividad.
IRPF en fisioterapia: cuándo y cómo aplicarlo
El IVA y el IRPF son impuestos distintos y estar exento de uno no implica estarlo del otro.
Como fisioterapeuta autónomo, cuando prestes servicios a empresas, entidades o profesionales autónomos (por ejemplo, a una clínica que te contrata como colaborador), debes aplicar una retención de IRPF en tu factura. Esa retención la ingresa el pagador directamente en Hacienda en tu nombre.
Los tipos de retención vigentes son:
- 15 % — tipo general para autónomos con más de dos años de actividad
- 7 % — tipo reducido durante los tres primeros años desde el inicio de la actividad profesional
Cuando facturas directamente a un paciente particular, no aplicas retención de IRPF. El paciente no puede ingresarla en Hacienda porque no es una entidad pagadora.
El IRPF que retienes en tus facturas se descuenta de lo que pagas en la declaración anual de la renta. No es un impuesto adicional: es un pago anticipado a cuenta de tu IRPF anual.
Verifactu en fisioterapia: qué es y cómo te afecta
Verifactu es el sistema de facturación electrónica verificable que la Agencia Tributaria ha implantado para garantizar la integridad de las facturas emitidas por empresas y autónomos. Su objetivo es eliminar el fraude fiscal asociado a programas que permiten alterar o borrar facturas.
¿Afecta a los fisioterapeutas?
Sí. Verifactu afecta a cualquier empresario o profesional autónomo que esté obligado a llevar el libro registro de facturas emitidas, lo que incluye a los fisioterapeutas en régimen de estimación directa (normal o simplificada).
Qué implica en la práctica
A partir de la entrada en vigor de la obligación, el software que uses para emitir facturas debe estar homologado con Verifactu. Esto significa que cada factura generará un registro que se envía (o queda disponible para enviar) a la AEAT, con un código QR de verificación en el documento.
No se puede seguir usando Excel, Word o un programa no homologado para emitir facturas si estás obligado a cumplir con Verifactu.
Qué debes hacer
Si ya usas un software de facturación, verifica que está homologado con Verifactu antes de seguir emitiendo facturas. Si todavía gestionas la facturación de forma manual, este es el momento de dar el paso a una solución específica para tu clínica.
En Docfav, el cumplimiento con Verifactu está integrado en el módulo de facturación: las facturas se generan con el registro requerido sin que tengas que hacer nada adicional. Puedes ver cómo funciona en nuestra página de software para fisioterapeutas
Cómo simplificar la facturación en tu clínica de fisioterapia
Gestionar la facturación a mano —con plantillas de Word o Excel— funciona cuando tienes muy pocos pacientes. En cuanto el volumen crece, el tiempo dedicado a facturar crece con él, y también el riesgo de errores: facturas sin número correlativo, retenciones mal calculadas o series que no se gestionan correctamente.
Un software de facturación específico para fisioterapia resuelve esto de forma automática:
- Genera la factura desde la propia cita, sin duplicar trabajo
- Aplica la exención de IVA o el tipo correspondiente según el servicio configurado
- Gestiona la retención de IRPF cuando el pagador es una entidad
- Controla cobros pendientes y pagos de aseguradoras
- Cumple con Verifactu sin configuración adicional